請問一下有關公司的網路監控問題

前幾天, 我妹問了我一個問題, 但是我不會回答, 所以來請教一下:
她說當她準備要把 NB 關閉時, 出現了類似 "現在正有電腦連接到妳的電腦, 若是關閉的話, 會造成錯誤..." 之類的訊息. NB 是她自己的, 在公司是用公司的 "有線" 網路. 她是有聽說老闆會監控電腦, 看妳是在幹什麼... (例如有沒有在用 MSN 聊天...) 但是出現這個訊息之後, 她突然覺得 "很沒有隱私權"! 會不會連 E-Mail 之類的都被看光光了!? 光是連到公司的網路, 就會等於電腦被入侵了嗎!? 她應該是沒有設定 "檔案分享" 啦... 還是因為公司有 "監看系統" 可以解析進出的所有封包嗎!? 若是這種情況下, 有辦法防止嗎!? 像是說裝個軟體之類的... 我是說不然的話, 不要用公司的網路, 看看附近有沒有可用的無線網路!? 但是這樣會不會反而造成 "反效果" 而被懷疑!? 希望我解釋的 "大綱" 夠清楚, 讓好心的高手能指教......