工程保留款

找不到要去哪個主題發問~來這問看看有沒有人可以幫我解答~謝謝

我們工程都要押10%的保留款~可是我最近遇到一家客戶他跟我之前放款不太一樣想請問一下~
例如這次請款1,000,000元*0.05稅額+50,000元=1,050,000
客戶放款給我應該是要1,050,000元-10%保留款100,000元=950,000(放款金額)
可是這次這家客戶她們放款是1,000,000元-10%保留款100,000元=900,000元*0.05稅額45,000元=945,000元
他就放款945,000元的金額給我~那這樣我開給她的發票就有出入了~

遇到這種情形想要請問保留款到底是要怎麼扣法~我有點不太清楚~因為我是在家裡幫忙不是本科系對會計也不了解~有人可以幫我解答嗎?謝謝