保險公司代位求償是什麼意思

各位大大好：我爸爸日前遇到一個闖紅燈撞我爸爸的年輕人，當下我爸爸想說沒什麼大礙就算了，對方也同意，誰知我爸回家後，對方叫警察來，說我爸肇事逃逸，於是我爸就跑警局做筆錄，也調閱路口監視器畫面（畫面是：對方過停止線時是黃燈，過了之後才紅燈，我爸這邊是綠燈）接著我爸上法院開庭，對方也沒去開庭，於是我爸請法官明鑑，若是我方有疏失，我們一定負責到底！
然後對方提和解，對方的保險公司也跟對方一起去談和解，談不成後，他們就走人了，接著我爸收到一則手機訊息說「對方投保他們公司的車體險，此交通事故的修理費用為15650，對方保險公司已支付完畢，依法向我爸代位求償」
我的問題是：
1、對方才是闖紅燈的人，為什麼我們要賠他（縱使黃燈也不代表他是對的啊，我們這邊是綠燈耶）不然中華民國的交通號誌是要什麼燈才能過馬路！
2、肇逃歸肇逃，而且我們也有解釋給法官聽了！
3、他買保險當然要幫他做理賠啊，我還第一次聽到保險公司先出錢理賠，然後再替他向我們代位求償，這到底是怎麼回事！
麻煩各位替我解答，教教我接下來該怎麼處理才好！🙏