One A9S延續One A9的指紋辨識功能，螢幕下方Home鍵即指紋辨識區，指紋辨識支援HTC Boost+程式將App上鎖。不過，One A9S拿掉了原本A9螢幕下方的HTC Logo，看起來更為清爽。在外觀上還有一個明顯差異之處，原本One A9的主相機鏡頭在背面上方的中間，而One A9S改至偏左的位置，如此一來就更像iPhone 6/6S系列了。
在硬體規格方面，原先One A9是高通Snapdragon 617，而One A9S改成今年多款手機採用的聯發科helio P10(例如~OPPO R9、Sony Xperia XA/X Ultra都是)，採用LTE Cat.6 modem可支援2CA。記憶體與容量則是未改變，同樣提供2GB RAM/16GB容量與3GB RAM/32GB容量兩種選擇。
相機規格也變動不小，One A9S主相機維持1300萬畫素(sensor仍未知)，鏡頭光圈改為F/2.2(A9是F/2.0)，似乎拿掉了OIS光學防手震。One A9S的前相機變更為500萬畫素，原本A9是410萬畫素的UltraPixel。
One A9的電池容量從2150mAh提升至2300mAh，但處理器改為聯發科，因此不支援高通快充，官方提供的充電規格輸入僅5V/1.5A，傳輸規格維持microUSB，沒有改成USB Type-C。整體而言，One A9S雖仍維持優雅的外觀，實際上規格卻降了不少，跟去年One M9與M9S的情況類似，並非進階版而是Lite版。
另外，HTC 10發表時推出的自由桌面，One A9+也會支援。
HTC One A9主要規格：
◎作業系統：Android 6.0 with HTC Sense
◎處理器：聯發科helio P10八核心2.0GHz
◎記憶體：2GB/3GB
◎儲存容量：16GB/32GB (microSD擴充最大2TB)
◎螢幕：5吋720P SLCD，康寧大猩猩玻璃
◎LTE頻段：FDD 700a/700b/APT 700/800/850/900/1800/1900/2100/2600 MHz；TDD 2300/2600 MHz
◎主相機：F/2.2光圈、1300萬畫素、1080P錄影，支援專業模式/全景模式/HTC Zoe
◎前相機：500萬畫素、1080P錄影， 支援美顏、聲控自拍。
◎電池：2300mAh(5V/1.5A充電輸入)
◎感應器：光、距離、電磁、加速度、電子羅盤、指紋辨識
◎衛星定位：GPS、GLONASS
◎其它：NFC、藍牙4.2、Wi-Fi 802.11 a/b/g/n、HTC Connect
◎尺寸：146.49 x 71.5 x 7.99mm
◎重量：149.8g
這隻到底是出來幹嘛的阿...
