日本人群與北方漢族人群聚類重疊

最大規模中國人基因庫首次發表:日本人群與北方漢族人群聚類重疊

https://www.hk01.com/%E5%8D%B3%E6%99%82%E4%B8%AD%E5%9C%8B/471889/%E6%9C%80%E5%A4%A7%E8%A6%8F%E6%A8%A1%E4%B8%AD%E5%9C%8B%E4%BA%BA%E5%9F%BA%E5%9B%A0%E5%BA%AB%E9%A6%96%E6%AC%A1%E7%99%BC%E8%A1%A8-%E6%97%A5%E6%9C%AC%E4%BA%BA%E7%BE%A4%E8%88%87%E5%8C%97%E6%96%B9%E6%BC%A2%E6%97%8F%E4%BA%BA%E7%BE%A4%E8%81%9A%E9%A1%9E%E9%87%8D%E7%96%8A


撰文:蘇子牧

20-05-12 10:15
日前,最大規模中國人基因庫研究結果首次發表,對覆蓋中國27個省份和直轄市,8個民族,超過1萬人的高深度全基因組測序數據和表型的系統性分析。

研究揭示了漢族人群可顯著分成7個亞群:北方漢族、西北漢族、東部漢族、中部漢族、南方漢族、東南漢族、和嶺南漢族。

此外,研究者在成分分析中發現,日本人群與中國北方漢族人群聚類完全重疊。

4月30日,瑞金醫院內分泌科領銜的ChinaMAP(中國代謝解析計劃)聯盟攜29家研究機構和醫院,在中科院上海生命科學研究院主辦的《Cell Research》雜誌首次報道了對覆蓋中國27個省份和直轄市,8個民族,超過1萬人的高深度全基因組測序數據和表型的系統性分析。

中國人基因庫研究發現,漢族可分成7個亞群。(上海交通大學醫學院附屬瑞金醫院微信公號)

研究團隊對隊列中代表中國不同地區和民族的10,588人DNA樣本進行了40×深度全基因組測序,完成了高質量的中國人群遺傳變異數據構建、中國人群體結構分析、基因組特徵比較以及變異頻譜和致病性變異解析。

研究覆蓋了中國七大地理區域,包括了人口排名前十的漢族、壯族、回族、滿族、苗族、彝族、藏族和蒙古族。

研究團隊首次揭示了漢族人群可顯著分成7個亞群:北方漢族、西北漢族、東部漢族、中部漢族、南方漢族、東南漢族、和嶺南漢族。

河西走廊人群基因多態性位點數量更多

少數民族中,藏族、彝族、蒙古族、苗族和壯族都有着獨特的人群聚類,而滿族和北方漢族相近,回族和西北、北方漢族相近。不同地域人群的變異特徵也與中國歷史上的人口遷徙和變遷相關,例如河西走廊是絲綢之路中不同民族遷徙的交通要道,歷史上包括粟特人等許多民族曾在此經商生活。


河西走廊是絲綢之路中不同民族遷徙的交通要道,歷史上包括粟特人等許多民族曾在此經商生活。圖為在甘肅敦煌莫高窟遊覽的民眾。(資料圖片)

研究揭示,現代河西走廊地區的人們具有的基因多態性位點數量更多更復雜。與全世界其他人群相比,中國人的遺傳特徵與歐洲、非洲、南亞和拉丁美洲人群之間存在着巨大差異,與非洲人群差距最大,而與東亞人群非常相似。

研究者在成分分析中發現,日本人群與中國北方漢族人群聚類完全重疊。聚類是把相似的物件通過靜態分類的方法分成不同的組別或者更多的子集(subset),這樣讓在同一個子集中的成員物件都有相似的一些屬性。

此外,ChinaMAP對中國人的營養代謝和藥物代謝相關遺傳特徵也進行了分析比較。

研究稱,福建人和廣東人的酒量排在全國各省最後。(資料圖片)

總體上北方人比南方人酒量更好

對受到廣泛關注的酒精代謝能力,從總體上看,北方人比南方人酒量相對更好,藏族、蒙古族、彝族人民和河南人酒量居於前列,不過,坊間傳言善於飲酒的山東人酒量並不突出,而福建人和廣東人的酒量則排在最後。

ChinaMAP證實,導致喝酒臉紅和酒精代謝能力差的乙醛脱氫酶2基因rs671變異是東亞人特異性的,在中國人群中的攜帶者遠高於全球其他人群。rs671變異也是誘發食管癌發生的重要風險因素,所以喝酒臉紅應少喝酒。

另外,一個人攜帶的某個基因變異產生的疾病風險可能並不大,但綜合多個基因變異的作用後對個體特徵有重大影響
這不是廢話?日本三神器大概是河南省某個縣做的玩意吧?
日本人自行研究 血統近於蒙古族
因此,不管是上古時代遷移
或是因為元寇來襲的神風幫忙,
讓大量蒙古人加入日本,
其實,基因學早有研究。

台灣的南島血統,其實被日劇同化
那些日本遺民 應該認清日本研究。
別再丟臉。

最新一期的《自然》
南島語族源自中國南方

Ancient human genomes shed new light on East Asia's history

https://www.nature.com/articles/d41586-020-01456-9

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人之初、分南北,9500年前南北方人就“分家”了

https://www.thepaper.cn/newsDetail_forward_7411882

中國科學報-科學網

2020-05-15 18:12

福建奇和洞約8400年前的2號個體頭骨。平潭國際南島語族研究院范雪春供圖

中國科學報-科學網5月15日消息,你是誰?從哪裡來?要到哪裡去?這三個“終極問題”,不僅是小區保安天天要問的,也是古人類學家孜孜以求的“聖杯”。

5月15日,《科學》雜誌在線發表了中國科學院古脊椎動物與古人類研究所研究員付巧妹團隊獨立主導、多家單位參與的一篇研究論文。該論文從遺傳學角度揭開有關中國南北方史前人群格局及遷移與混合這一重大學術問題上的若干謎團,填補了東方、尤其是中國地區史前人類遺傳、演化、適應的重要信息缺環。

南北方人,9500年前就“分家”了

近年來,與東亞毗鄰的東南亞、西伯利亞等地的古代人類遺傳演化研究已取得很多成果,但迄今為止,東亞、尤其是中國南北方,史前人類基因組的相關信息卻所知甚少。

“人類演化史中,不能缺少來自中國的重要篇章。”抱著這個想法,付巧妹團隊聯合多家科研機構,依托先進的古DNA技術,成功捕獲並測序了中國北方山東、內蒙古及南方福建、毗鄰亮島和鎖港等地11個遺址的25個9500~4200年前的個體和1個300年前個體的基因組。

這些古老的證據,為大時空框架下研究東亞古人群,尤其是現代人的遷徙與演化歷史提供了重要的遺傳學證據,這也是首次針對中國南北方人群展開的時間跨度最大的系統性古基因組研究。

他們發現,在沿著黃河流域直到西伯利亞東部草原的人群裡,至少從9500年前起,就都攜有一種以新石器時代山東個體為代表的古北方人群成分,而中國大陸沿海及台灣海峽島嶼人群至少從8400年前起就攜有一種以新石器時代福建及其毗鄰島嶼個體為代表的古南方人群成分,而且這兩種成分截然不同。

“這就是說,早在9500年前,中國的南北方人群就已經分化了。”付巧妹告訴《中國科學報》,“然而隨著時間的推移,南北方人之間的差異性和分化程度又開始逐漸縮小了,這種變化暗示著,自新石器時代以來,南北方人之間已經有了頻繁的遷移與混合。”

有趣的是,中國南北方人的這種“互動”跟歐洲人群截然不同。在約9000年前農業出現以來,歐洲人群就不斷受到近東農業人群及歐亞草原人群等外來群體的“大換血”,外來人群一直在重構歐洲人群遺傳信息。

可在中國,南、北方同期人群的演化一直是基本連續的,沒有受到外來人群的明顯影響,似乎一直“肥水不流外人田”。

付巧妹分析,這可能與中國是稻作和粟作農業的獨立起源中心有關。“農業對人口擴增的影響是巨大的。農業不是在歐洲本土起源的,外來人群帶來了農業,就可能很快在當地擴張起來;而中國人有自己的農業,能自給自足,何不'自得其樂'呢?”

進擊的“胡建人”

研究人員發現,古南方人群成分雖然在現今東亞大陸人群中所佔比例較小,卻對其他地區的人群具有廣泛的影響。現代遺傳學和新石器時代中期以來的考古學材料雖已暗示了南島語係人群與東亞南方大陸人群之間的聯繫,但對其起源地卻一直沒有定論。

此次付巧妹團隊的研究,終於找到了確鑿的遺傳學證據。他們通過研究發現,現今廣泛分佈於台灣海峽、東南亞和太平洋西南部島嶼的南島語係人群,與新石器時代的中國南方沿海人群有著非常密切的遺傳聯繫。

這表明,最早的南島語係人群起源於與中國南方的福建及其毗鄰地區相關人群,並且這一時間可以明確追溯到8400年前。“這是第一次我們通過古基因組數據明確了中國8000多年前的古南方人群是南島語係人群的祖先來源。”付巧妹說。

值得一提的是,相較於現今生活在東亞北方和西部人群(如達斡爾族人群),福建8400年前的奇和洞人顯示出與東亞現今中部和南方人群(如漢族和傣族人群)存在著更多的遺傳聯繫,且與中國台灣的阿美族和泰雅族人群具有最強的遺傳聯繫,反映出現今族群之間的聯繫性。

中科院院長白春禮評價稱,這項成果對於“探索中國史前人群的遷徙歷史、遺傳格局及內部融合過程,對於明確現今主要生活在中國台灣及太平洋島嶼等地的南島語係人群的祖先來源,具有重大的科學價值和社會意義”。

“釣”DNA的古人類“神探”

付巧妹團隊的這項研究不僅揭示出南方大陸人群與北方大陸人群的遺傳聯繫,而且證實了南島語係人群的中國南方起源。審稿專家對此高度評價道:“研究提供了非常珍貴的基因組數據,其代表的時間和區域是前所未有而又必不可少的。”

這項研究工作自2012年起即已開始籌備,歷時8年,終於取得重大突破。其實早在2014年,她和團隊成員便已成功獲得北方山東和南方島嶼亮島的幾個關鍵樣本的基因組數據,對東亞南北方古人群遺傳特點得出了非常有價值的研究進展。

可她卻總覺得,自己還沒有被說服。“亮島是個島嶼,大家都知道,島上的人跟大陸上的人有可能是完全不同的。”於是,付巧妹帶領團隊,開始了長達六年的南方大陸樣品“攻堅戰”。

然而,中國南方炎熱潮濕的氣候非常不利於骨骼的保存,因而來自南方的樣本材料不僅稀少,而且微生物DNA污染嚴重,人類的DNA常常被高度甚至完全降解,這讓相關實驗和研究難上加難。在近4年的時間裡,他們深入南方30多個遺址採集了257例古代人類樣本,卻常常遇到樣本完全不含古DNA,或是保存條件太差而無法提取的情況。

幸而,他們在古DNA關鍵技術方面取得了新的突破,如他們與合作單位共同開發的古DNA捕獲技術,能夠從大量土壤微生物DNA裡“釣取”極其微量的人類內源DNA,曾成功捕獲僅佔0.03%的人類核DNA。

正是這些“蛛絲馬跡”,讓付巧妹成為了一名古人類“神探”,她抽絲剝繭,最終拼就了一幅中國史前人群的起源地圖,而這幅地圖,也讓人類的歷史,變得更加完整。


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NEWS 14 MAY 2020

Ancient human genomes shed new light on East Asia's history

First large-scale ancient genome analyses from China chart migrations of early farmers.
Ewen Callaway

Whole skeleton of Qihe 2, a ~8,400-year-old individual from Qihe cave, Fujian, China.
An 8,400-year-old skeleton from the Qihe cave archaeological site in Fujian, China.Credit: Xiujie Wu/Institute of Vertebrate Paleontology and Paleoanthropology

Ancient genomics is starting to unravel the history of East Asia. The first large-scale studies of ancient human genomes from the region suggest that many of its inhabitants descend from two once-distinct populations that began mixing after the development of agriculture some 10,000 years ago.

The studies also reveal connections between ancient humans that extend from southern China to the South Pacific, and a link between coastal inhabitants that could offer clues about how humans came to settle in East Asia.

The findings come from a 14 May study in Science that analysed the genomes of two dozen ancient Chinese people1, and a March preprint that looked at nearly 200 ancient genomes from across East Asia2.


Ancient African genomes offer glimpse into early human history
Contemporary East Asians descend, by and large, from humans who left Africa 50,000 to 100,000 years ago. But researchers know little about the ancient population shifts that have since shaped the genomes of the region’s 1.7 billion current inhabitants. Only a handful of ancient-human genomes from East Asia have been published, and it is not clear how key events, such as the spread of farming — which drastically altered the genetic make-up of western Eurasians — affected this part of the world.

A team led by Qiaomei Fu, a population geneticist at the Institute of Vertebrate Paleontology and Paleoanthropology in Beijing, analysed the genomes of 24 individuals who lived in East Asia, including what is now China, between 9,500 and 300 years ago. Most of the genomes came from archaeological sites in the Yellow River Basin in northeastern China, or more than 1,000 kilometres away, in southeast China’s Fujian province.

North–South divide
During the early Neolithic period, around 10,000 to 6,000 years ago, people from these two geographic regions were genetically distinct, Fu’s team found. But over time, they began mixing: contemporary Chinese trace much of their ancestry to the northern groups, but are also related to the ancient Fujian people to varying degrees (those from southern China tend to be closest). Fu’s team doesn’t know exactly when the two groups started to interbreed, but it saw signs that the northern genetic signature had begun spreading into southeast China by the time of the late Neolithic 5,000–4,000 years ago.

This suggests that farming in East Asia could have spread through mixing of farmers and hunter-gatherers, says Ling Qin, an archaeologist at Peking University in Beijing. That’s different from what ancient-genome studies have found in western Eurasia, where farmers with Middle Eastern ancestry largely replaced hunter-gatherers in Europe.

Farmers in the Yellow River Basin also moved west. A team led by David Reich, a population geneticist at Harvard Medical School in Boston, Massachusetts, who is a co-author of Fu’s study, analysed the genomes of 20 5,000-year-old individuals from this region and found connections with contemporary Tibetans. Their results are part of a study of 191 ancient individuals from East Asia that was posted to the bioRxiv preprint server on 25 March.

Distant relatives
The studies also revealed some surprising long-distance connections. Neolithic people who lived near China’s coast, whether in the northeast or southeast, shared some ancestry with ancient individuals from coastal sites in southeast Asia and Japan. “That means the entire coast of East Asia is a really important place for people to migrate,” says Fu. Reich and his team found a similar connection, which they say could be evidence that modern humans first settled in East Asia along a coastal route.


Evidence mounts for interbreeding bonanza in ancient human species
Ancestry from southeastern China stretched even farther afield. Neolithic individuals from Fujian and islands in the Taiwan Strait were closely related to ancient islanders from Vanuatu in remote Oceania, Fu’s team found. Previous ancient-genome studies had recorded the spread of this ancestry from East Asia to Oceania, and Fu’s study suggests that this group originated in southern China.

This conclusion makes sense, says Matthew Spriggs, an archaeologist at Australian National University in Canberra. Archaeological and genetic evidence has linked the South Pacific migration to ancient humans in Taiwan, whose Neolithic inhabitants probably came from southern parts of the mainland. “I am very pleased to see this paper,” he says of Fu’s study.

Qin says that the ancient southern Chinese people in Fu’s study lived in an isolated pocket that might not be representative of the wider area. A priority should be sequencing DNA from early farmers from the Yangtze River Basin in southern China, a centre for rice domestication and a potential source of other migrations, she adds.

The studies also give researchers hope that ancient genomics will help them delve even deeper into East Asia’s early history. Pontus Skoglund, a population geneticist at the Francis Crick Institute in London, would love to know whether the first Homo sapiens to settle in the region interbred with Denisovans, an extinct group of hominins. "I think one of the most exciting open big questions of the region relates to the pre-Neolithic settlement — who were the earliest modern humans in the region?" adds Martin Sikora, a geneticist at the University of Copenhagen.

doi: 10.1038/d41586-020-01456-9
References
1.
M. A. Yang et al. Science https://doi.org/10.1126/science.aba0909 (2020).

ArticleGoogle Scholar
2.
Wang, C.-C. et al. Preprint at bioRxiv https://doi.org/10.1101/2020.03.25.004606 (2020).
其實北方人基因多數有蒙古血統,這並不奇怪
縱使身朽武藏野 生生不息大和魂
台灣是南島語系民族的發源地,也很可能是中國人的祖先

也可能遷移到日本,後再到中國

如果日本是中國的近祖先,那台灣更可能是中國的遠祖先

 

 
 
縱使身朽武藏野 生生不息大和魂
nomo333 wrote:
最大規模中國人基因庫(恕刪)


日本又要是中國不可分割的一部分了嗎
Stereophotography wrote:
日本又要是中國不可分割的一部分了嗎


是相反才對

證明有同質性,應該是為了證明日本人是中國人的祖先

所以... 中國是日本不可分割的一部分
縱使身朽武藏野 生生不息大和魂
ho520 wrote:
是相反才對

證明有同質性,應該是為了證明日本人是中國人的祖先

所以... 中國是日本不可分割的一部分



哈哈哈 神武天皇都笑了
哈哈哈 徐福也笑了
ho520 wrote:
台灣是南島語系民族的(恕刪)


你知道南島民族是先從大陸移居台灣.再從台灣出發經菲律賓往外移的嗎
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