組過RAID 0的硬碟 拆除RAID之後如何格式化

小弟的電腦
配備如下
CUP amd phenom ii x4 925
MB MSI 770-C45
RAM OCZ 1333*2
VGA MSI R4870 MD1G
HDD WD 6401AALS*2
WD 1001FALS*1
PUS SEED 550W

小弟拿6401AALS 組RAID 0
1001FALS 當資料碟

可是最近取消RAID 0
單用一顆640G當系統碟
可以順利安裝windows 7
可是開機進入windows 7進不去
會進入啟動修復 如果讓他啟動修護
電腦還是無法修復
只會出現D:有問題
可是我D:單顆640G只是拿來存放一些資料
重灌還是一樣

也在DOS下檢查過硬碟並無壞軌
還是說組過RAID的硬碟 拆除RAID要特殊的格式化

麻煩高手指點一下