眼鏡頂點距離/瞳高問題

不確定標題的專有名詞與我的問題點是否正確，
舊眼鏡鏡片磨損嚴重，便找了網路評價驗光仔細的眼鏡行配新鏡片，
過程中眼鏡行只檢查一下舊鏡框是否堪用嗎，還提到我鏡框保養得還不錯，便開始驗光。

驗光結束後，我有提到之前配眼鏡的店家會在鏡片上標示眼睛瞳孔位置的記號，
店家說到時候眼鏡配好了，再調整就可以了，連叫我戴一下給他看都沒有（我當時臉上是備用眼鏡）。

新眼鏡目前是慣用眼戴了一整天後會特別疲勞與酸澀，而且抬頭仰視的成像效果比較好，
回去店家確認問題點後，店家說因為我習慣戴比較低，
所以眼鏡與鏡片的距離太遠，成像效果不佳，眼睛才特別疲勞。
然後在鏡片上標示記號讓我看，說眼睛的位子沒在鏡片的中心點，
調整了一下鏡框後便要請我回去再試試看。

想問問大家的經驗，眼鏡跟瞳孔相對應的位子是鏡片磨好事後再調整，
還是應該是眼鏡調整好後，再依客人覺得戴的舒適的位子製作鏡片?
因為目前如果把眼鏡調到中心點的位子後，戴起來會覺得很不舒服，
所以目前只是先稍微微調一下下讓我回去再適應，
不知道需要來回幾次才可以解決…

p.s.前次鏡片為台製鏡片，這次改使用蔡司。
新鏡片慣用眼度數有+25度