wiki 埔里至花蓮段共有20座長隧道,這些隧道預估總合長度有47.4公里[註 1],其中在「第13號隧道」須通過能高山,光是地質探勘之用的導坑就有15.1公里長,一旦貫通,預估工程費用將耗資新台幣50億元,其長度將超過雪山隧道,其工程難度更甚。第13號隧道隧道計畫在海拔高1,200公尺處左右穿過海拔3,000餘公尺高的能高山之山腹,其地質存在著地熱、斷層、岩爆、湧水等不確定因素,而其中最大的工程問題在於岩爆,受到隧道上方的地層被覆擠壓,其壓力隨岩覆之增而增,在海拔1,200公尺處開挖隧道,其岩覆將至少有1,500公尺,因此岩爆深危工程人員的安全,也會摧毀工程機具而難以進行。此外,長隧道還存有通風問題,因深入山腹作業,淤積的熱氣在隧道內,不利於工程人員在高溫環境下作業,更因穿過廬山地熱區,開挖作業過程中隨時會有高壓水蒸氣噴出,加遽了隧道內高溫環境[註 2],也危及工程人員的安全。