總統大選期間，民進黨國防政策藍皮書表示，為強化台灣的資電作戰能力，將在現行陸海空三軍之外，增設上將位階的「第四軍種」，整合軍方現有的資電作戰指揮部、電訊發展室，並吸納情報次長室、通資次長室等單位的相關業務，成立類似「資電司令部」的第四軍種，屆時會在維持國軍七位上將編制不變的情形下，由副參謀總長執行官來兼任第四軍種司令的職務。不過，今日在忠信營區成軍的資通電軍指揮部規模並沒這麼大。
總統蔡英文則在國防部長馮世寬陪同下前往視察，並宣讀指揮部編成令，親自為指揮部授旗、授印。蔡英文致詞表示，今天是歷史性的一刻。資通電軍指揮部的成軍，代表台灣的國防將全面性地進入資訊作戰的時代。
蔡英文表示，要把資安位階提升到國家安全層次。成立資通電軍，就是一項「把資安視為國安」的具體行動。台灣絕對有足夠的技術和人力資源，來建構完整的資安防護網，只是一直欠缺整合的作為和決心。以國軍來說，資訊、通訊和電子作戰的相關任務，過去分散在資電作戰指揮部、電訊發展室，以及各軍種的部隊。
蔡英文說，未來，「資通電指揮部」將擔負戰力整合的角色，在通信電子資訊次長室的戰略引導下，藉由中科院和民間產學的技術支援，打造一支完整的作戰兵力。
蔡英文表示，今天指揮部的編成典禮只是第一步。資通電軍將以網路攻防為核心，通訊安全為基礎，電磁發展為前瞻。
她還說，資通電軍要超越傳統的空中、海域及地面的防衛概念，成為重層嚇阻戰略下的第一層嚇阻兵力，並超越各軍種的藩籬，作為國軍聯合作戰的典範。
蔡英文表示，台灣有最堅定的自我防衛決心。有形國土，台灣捍衛到底；數位國土，也絕不讓步。她會跟各位一起並肩作戰，勇敢前進。
至於新任指揮官馬英漢少將背景，國防部指出，陸軍官校74年班畢業，先後完成陸軍指參學院、戰爭學院等深造教育，並獲得元智大學資訊管理碩士學位，歷任聯勤通信電子器材基勤廠廠長、國防部通次室資通安全處長、資電作戰指揮部指揮官等職務，學、經歷完整。
台灣還需要成立這些另類的軍種嗎，早就有類似的了吧，也不需要像成立一大堆委員會一樣，多浪費民脂民膏吧，而且他會跟各位一起在電腦前並肩作戰，勇敢前進。哈哈
