BMW 435 (N55) 寫BM3二階+XHP二階(含高流量濾芯/直通當派) 改完比原廠難開？

我本身對於動力改裝沒有過多研究，大多數聽從車友介紹。
事情是這樣子，一直不喜歡原廠的雙出排氣管，所以騷咖稱，去車友介紹的改裝店，改了四出尾飾+M4後包。
並聽從車友的建議，入坑內寫BM3.....全部報價38500(BM3二階+變速箱XHP2階+直通當派+高流量濾心)
BM3是什麼，我也不知道！店家只說提升馬力，排氣更順。

約好時間把車子放在店裡，晚上來簽車後.付款.離開。
回程路上越開越奇怪，為什麼起步踩油門反應那麼慢？感覺很無力 (聽轉速的聲音更明顯)
後來詢問店家，店家說直通的確實會這樣...(OS:乾！你怎麼不早說）
店家:如果起步要有力，就得換200目當派，但中尾速就不像現在這麼順..
我:平常都在台北市區走走停停的，我認為中尾速不要比原廠差就好 ...
店家:如果要換200目再貼我11000
我:我先開一陣子，真的不習慣再來換。
（補充:我的直通當派、高流量濾心，啥品牌我也不知道..最後問了才知道，沒品牌.）

好了！陸陸續續又開了三個月…過程中遇到偶發性的狀況：
1.回油時，頓挫感很明顯，很像被踹一腳 (雖然原廠也會這樣，但很輕微)
2.在等紅燈時，偶爾會遇到整台車很嚴重的抖動，有時候又不會
3.起步很軟，比原廠軟太多，必須切到SPORT模式才會好一點(SPORT模式在市區開也是很難受)

因原店家可能很忙，幾乎沒太多明確的建議和說明，幾個疑問想請教有經驗的車友：
1.我不知道，當初改BM3到底寫了什麼？會不會沒寫好影響車輛後續的安全性？
2.想換成200目，但已不想回原店改裝，網上做了些功課，MACH5和FI這兩個品牌的200目效果與沒品牌的有差嗎？(考慮更換MACH5或FI)
3.店家告知我刷了BM3二階，馬力提升到405HP/扭力55.5kg 有可能嗎？（開起來沒感覺）
4.店家說有幫我寫XHP二階變速箱，我要怎麼查證？（問他寫了什麼，也沒明確的說明，實在很懶得再追問了）
ps.小弟的車是2015年435i總代理，購買至今總里程4萬，平常很少開！